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1. 提神醒腦
相信不少人都是把咖啡當成提神飲料，的確，咖啡所含的咖啡因，能夠阻擋腺苷（Adenosine），它是一種抑制性神經傳導物質，能促進睡眠。此外，咖啡因也會提高腎上腺素（Adrenaline）及多巴胺（Dopamine），產生提神的作用。
2. 燃燒脂肪
不少研究顯示，咖啡因可以增加新陳代謝率，但建議只攝取黑咖啡，倘若加入奶精、糖和牛奶，熱量就會提高，反而不利燃脂減肥。
3. 抗氧化劑的來源
對於現在飲食大幅西化的台灣人來說，許多人可能一天吃不到多少青菜和水果，造成抗氧化劑的攝取減少了，咖啡反而是除了蔬果外，最適合攝取抗氧化劑的來源。此外，咖啡還可以幫助細胞對抗自由基的攻擊，而且咖啡所含的的綠原酸（Chlorogenic acid）和咖啡酸（Caffeic acid），可以消除自由基。
4. 幫助燃脂、提升耐力和運動表現
咖啡因不只可以增加腎上腺素的分泌，也能幫助燃燒脂肪，產生自由脂肪酸，作為提供身體活動的燃料。美國國家生物技術資訊中心(簡稱NCBI）研究也指出，咖啡因可以增加運動時的力量和耐力。
5. 預防糖尿病
第二型糖尿病（Type 2 diabetes）的主因是胰島素阻抗（Insulin resistance），或是胰島素分泌能力減低，所造成的疾病。喝咖啡可以降低罹患第二型糖尿病的風險。另外，咖啡裡所含的綠原酸可以降低葡萄糖進入血液的速度，也能避免產生胰島素抗性的狀況。
6. 防肝癌和大腸癌
咖啡有預防肝癌和大腸癌的功效。科學指南上的研究報導顯示，平日習慣喝咖啡的人，罹患肝癌的機率降低了40%左右，若每天喝4杯咖啡以上，還能大幅降低肝硬化機率達80%；每天喝4~5杯咖啡，罹患大腸癌的機率降低15%。
7. 可預防失智症
失智症是所有失智相關疾病的總稱，阿茲海默症就是其中一種，俗稱老人癡呆，通常發生在65歲以上的老人身上。由於沒有根治的辦法，一般來說，只能透過經常性的運動及健康飲食來預防，有喝咖啡習慣的人相較於其他人，得阿茲海默症的機率降低了65%。
8. 可預防帕金森氏症
帕金森氏症跟阿茲海默症一樣，都屬於神經退化性疾病，而且一樣無法根治。有喝咖啡習慣的人，得帕金森氏症的機率會下降，因為其效果是來自咖啡因，若飲用無咖啡因的咖啡則沒有效果。
9. 降低中風機率
平常會喝咖啡的人，血壓升高幅度十分微小，甚至幾乎沒影響，但仍建議本身就有高血壓症狀的人咖啡只能適量的喝。目前沒有研究指出咖啡因會增加罹患心血管疾病的風險，咖啡因反而會降低罹患中風的機率。
10. 降低死亡率延長壽命
咖啡具有護肝、防癌和燃脂等效果，進而幫助延長壽命。美國國家生物技術資訊中心的一項研究指出，喝咖啡可以降低20%的男性死亡率，以及26%的女性死亡率。